Η ιστορία της Ακαδημίας του Ολυμπιακού είναι μακρά και άκρως επιτυχημένη. Ιδρύθηκε τον Νοέμβριο του 1974 επί προεδρίας Νίκου Γουλανδρή έχοντας επικεφαλής τον κ. Βυτινάρο. Προάγγελος της Ακαδημίας και συγκεκριμένα της ομάδας Νέων ήταν οι θρυλικοί «Μπέμπηδες» που μεγαλούργησαν στη δεκαετία του ’60 με προπονητή τον Τζίνα Σιμανόφσκι. Τεράστιο ρόλο στην δημιουργία και ανάπτυξη της Ακαδημίας έπαιξε ο σπουδαίος τερματοφύλακας των πρώτων χρόνων της ιστορίας της ομάδας Αχιλλέας Γραμματικόπουλος ο οποίος και ανέδειξε πολλούς παίκτες. Στην Ακαδημία έχουν προσφέρει τεράστια ονόματα της ιστορίας του Συλλόγου όπως ο Θανάσης Μπέμπης, ο Ηλίας Ρωσσίδης, ο Ηλίας Υφαντής, ο Βασίλης Καραπιάλης και πολλοί άλλοι.
Οι ομάδες της Ακαδημίας συμμετέχουν σε διοργανώσεις στην Ελλάδα αλλά και στην Ευρώπη. Οι ομάδες Κ20, Κ17, Κ15 διακρίνονται στα αντίστοιχα Πανελλήνια Πρωταθλήματα που διοργανώνει η Super League Greece από το 2006 (Κ20, Κ17) και από το 2013 (Κ15).
Ο ΟΛΥΜΠΙΑΚΟΣ έχει σαρώσει τους τίτλους στα Πρωταθλήματα Super League Υποδομών την περίοδο προεδρίας του κ. Μαρινάκη. Από το 2010 έως σήμερα οι ομάδες Κ15, Κ17 και Κ20 έχουν κατακτήσει συνολικά 13 Πρωταθλήματα Ελλάδος.
Η Ακαδημία έχει ως έδρα το Προπονητικό Κέντρο στο Ρέντη το οποίο χτίστηκε το 1965, ανακαινίστηκε το 2004 και μετά από το 2010 έχει «μεταμορφωθεί» σ’ ένα από τα καλύτερα στην Ευρώπη. Στο Προπονητικό Κέντρο υπάρχουν και ξενώνες στους οποίους φιλοξενούνται 28 παιδιά απ’ όλη την Ελλάδα και τα οποία αγωνίζονται στις ομάδες Κ-14 έως και Κ-20. Στην ακαδημία την τρέχουσα περίοδο 2018-2019 προπονούνται 200 παιδιά.
Η Ακαδημία του Ολυμπιακού έχει δημιουργήσει αξιόλογους ποδοσφαιριστές οι οποίοι αγωνίζονται όχι μόνο στην πρώτη ομάδα του Συλλόγου, αλλά και σε ομάδες της Super League και φυσικά στα κορυφαία Πρωταθλήματα της Ευρώπης.
Παίκτες από την Ακαδημία που έπαιξαν στην εθνική Ανδρών
| Όνομα | Συμμετοχές | Γκολ | Διοργάνωση |
| Κώστας Φορτούνης | 28 | 3 | Euro 2012 |
| Παναγιώτης Κονέ | 28 | 2 | Mundial 2014 |
| Κυριάκος Παπαδόπουλος | 26 | 4 | Euro 2012 |
| Γιάννης Φετφατζίδης | 25 | 3 | Euro 2012, Mundial 2014 |
| Δημήτρης Ελευθερόπουλος | 12 | – | |
| Δημήτρης Διαμαντάκος | 5 | – | |
| Χαράλαμπος Λυκογιάννης | 1 | – | |
| Παναγιώτης Ρέτσος | 1 | – |
ΠΑΙΚΤΕΣ ΑΚΑΔΗΜΙΑΣ ΠΟΥ ΕΧΟΥΝ ΠΑΙΞΕΙ CHAMPIONS LEAGUE
- Δημήτρης Ελευθερόπουλος (Ολυμπιακός)
- Κώστας Φορτούνης (Ολυμπιακός)
- Γιάννης Φετφατζίδης (Ολυμπιακός) / 1 γκολ
- Κυριάκος Παπαδόπουλος (Σάλκε, Λεβερκούζεν)
- Πραξιτέλης Βούρος (Ολυμπιακός, ΑΠΟΕΛ)
- Νίκος Βέργος (Ολυμπιακός)
- Χαράλαμπος Λυκογιάννης (Ολυμπιακός)
- Δημήτρης Διαμαντάκος (Ολυμπιακός)
- Κώστας Μενδρινός (Ολυμπιακός)
- Θανάσης Ανδρούτσος (Ολυμπιακός)
- Δημήτρης Νικολάου (Ολυμπιακός) / 1 γκολ
ΔΙΑΚΡΙΣΕΙΣ ΑΚΑΔΗΜΙΑΣ
Champions Super League
5 Super League U-20 (2010, 2013, 2015, 2016, 2017)
6 Super League U-17 (2010, 2011, 2015, 2017, 2018)
2 Super League U-15 (2014, 2016)
UEFA Youth League
4 seasons: (2013-14, 2014-15, 2015-16, 2016-17)
Best season: 2014-15 (Round of 16)
19 games (7 W, 7 D, 5 L)
Biggest Win: 4/11/2014: Juventus-OLYMPIACOS 0-3
Top scorers in UEFA club competitions: Nikolaos Vergos (6)
Player with most UEFA appearances: Qazim Laci (17)
Next Gen Series
1 season (2012-13)
Best season: 2012-13 (Quarter Final)
8 games (3 W, 3 D, 2 L)
Biggest Win: 12/9/2012: OLYMPIACOS-Arsenal 2-0
Top Scorers in Next Gen Series: Nikolaos Ioannidis (3)
Player with most appearances: Leantro, Siopis, Boutsiotis, Lyras, Ioannidis, Karagounis (8)
Παίκτες της Ακαδημίας στα Ευρωπαϊκά Πρωταθλήματα
Η Ακαδημία του Ολυμπιακού έχει δημιουργήσει αξιόλογους ποδοσφαιριστές οι οποίοι αγωνίζονται όχι μόνο στην πρώτη ομάδα του Συλλόγου, αλλά και σε ομάδες της Super League και φυσικά στα κορυφαία Πρωταθλήματα της Ευρώπης.
| Δημήτρης Ελευθερόπουλος | Μίλαν (Ιταλία) | 2005-06 |
| Γιάννης Φετφατζίδης | Τζένοα (Ιταλία) | 2013-15 |
| Παναγιώτης Ρέτσος | Μπάγερ Λεβερκούζεν (Γερμανία) | 2017 |
| Πραξιτέλης Βούρος | ΑΠΟΕΛ (Κύπρος) | 2017 |
| Κώστας Τσιμίκας | Βίλεμ (Ολλανδία) | 2017 |
| Νίκος Βέργος | Ρεάλ Μαδρίτης Β’ (Ισπανία) | 2016-17 |
| Χαράλαμπος Λυκογιάννης | Στουρμ Γκρατς (Αυστρία) | 2015-17 |
| Κυριάκος Παπαδόπουλος | Αμβούργο (Γερμανία) | 2017 |
| Αργύρης Καμπετσής | Μπορούσια Ντόρτμουντ (Γερμανία) | 2017 |
| Δημήτρης Διαμαντάκος | Μπόχουμ(Γερμανία) | 2017 |
| Κώστας Φορτούνης | Καϊζεσλάουτερν (Γερμανία) | 2011-2014 |
| Παναγιώτης Κονέ | Φιορεντίνα (Ιταλία) | 2016 |
| Μάρκο Γιάνκοβιτς | Παρτιζάν (Σερβία) | 2017 |
| Κώστας Ρουγκάλας | Βέστερλο (Βέλγιο) | 2017 |
| Καζίμ Λάτσι | Αζαξιό (Γαλλία) | 2017 |
| Μιχάλης Ηλιάδης | Σαλερνιτάτα (Ιταλία) | 2016-2017 |
| Νίκος Ιωαννίδης | Ντιοσγκιόρι (Ουγγαρία) | 2017 |